GeneCards — це всеосяжна онлайн-база даних про гени людини, яка надає інтегровану інформацію з численних джерел.
- Це геноцентрична база знань — тобто, основний фокус на людських генах.
- Інтегрує інформацію з понад 200 джерел, включаючи дані про:
- геномику (структура та функції генів),
- транскриптоміку (експресія генів),
- протеоміку (білки),
- генетичні варіації,
- хвороби, пов’язані з генами,
- клінічні дані тощо.
Що містить GeneCards?
- Більше 443 000 записів про гени, зокрема:
- ~44 000 — це офіційно затверджені гени (HGNC).
- ~22 000 — це гени, пов’язані з хворобами.
- Включає:
- білок-кодуючі гени,
- некодуючі РНК (ncRNA) — наприклад, lncRNA, miRNA,
- псевдогени,
- регуляторні елементи.
Які функції та інструменти?
- Потужний пошук за назвою гена або ключовими словами (наприклад, BRCA1, PCSK9, рак простати).
- Інструменти:
- GeneAnalytics — для функціонального аналізу,
- VarElect — для інтерпретації варіантів ДНК,
- GeneAlaCart — для пакетного аналізу генів,
- GenesLikeMe — знаходження схожих генів.
- Можливість завантажити дані, фільтрувати та аналізувати гени.