- Human Cell Atlas — це міжнародна наукова співпраця, яка має на меті створити докладну карту всіх типів клітин людського тіла протягом життя.
- Проєкт стартував у 2016 році.
- HCA використовує сучасні методи: single‑cell транскриптоміка, просторові технології, аналіз на різних стадіях розвитку тканин, для багатьох органів і систем.
Головні цілі
- Каталог всіх клітин — визначити всі типи клітин, їх стани (state), місце розташування в організмі, їх функцію.
- Розуміння здоров’я та захворювань — порівнюючи, як клітини функціонують у здорових станах і що змінюється в хворобі.
- Різноманіття — забезпечити репрезентативність: різні вікові групи, етнічні походження, географічні зони.
- Відкритість — дані, програмне забезпечення, методи будуть доступні широкому науковому співтовариству.
Що вже зроблено / досягнуто
- Широка кількість зразків — мільйони клітин проаналізовані з різних тканин та органів.
- Створені «мережі біологічних органів / систем» (Biological Networks) — кожна така мережа пише атлас для конкретного органа / системи.
- Є проєкти‑пілоти в Європі, що підтримують HCA, із застосуванням одно‑клітинних методів, просторових технологій, аналізу ядра клітин і т.ін.
Як користуватись HCA / що на порталі
- HCA Data Portal — основне місце, де можна шукати набори даних (datasets), клітинні типи, методи, тканини.
- Реєстр даних (Data Registry/Open Data) — наприклад, у AWS, щоб завантажити великі обсяги даних.
- Біологічні мережі (Biological Networks) — для кожного органа / системи атлас будується окремо, з відповідними зразками.
- Політики, умови використання — важливо ознайомитись з правилами використання даних, етики, репрезентативності тощо.