Перейти до вмісту

Hannum clock — епігенетичний годинник

    Hannum clock (2013) — епігенетичний годинник, розроблений Г. Хеннумом.
    Його особливість:

    працює в основному на крові (blood-specific epigenetic clock).

    Це не універсальна модель, як Horvath, а тканинно-специфічна.

    Структура та принцип

    • Використовує 71 CpG-сайт (менше, ніж Horvath)
    • Побудовано на даних Illumina 450K array
    • Модель: Elastic Net regression
    • Навчання виконано на:
      • мононуклеарних клітинах периферичної крові

    Що вимірює

    Визначає епігенетичний вік крові і вік імунної системи.

    Головне застосування:

    • імуносенесценція
    • імунні зміни з віком
    • імунні ризики

    Показник прискорення

    Age acceleration = DNAmAge – Chronological age

    • позитивне прискорення → старіння імунної системи
    • негативне → “молодша” кров

    Чутливість до факторів

    Hannum clock добре реагує на:

    • запалення
    • куріння
    • ожиріння
    • серцево-судинні ризики
    • діабет
    • інфекції

    Це робить його дуже корисним у клінічних дослідженнях крові.

    Порівняння з Horvath clock

    ВластивістьHannumHorvath
    Тканиникровмайже всі
    CpG71353
    Сильна сторонаімунна системауніверсальність
    Точність у кровівисокахороша
    Вік мозку, печінки тощопоганодобре

    Отже:

    • Hannum — для крові
    • Horvath — для всього організму

    Клінічні кореляції

    Прискорення за Hannum пов’язане з:

    • смертністю
    • серцево-судинними подіями
    • системним запаленням
    • фраilty (крихкість)
    • імунною дисфункцією

    Особливо показав себе в:

    • дослідженнях старіння крові
    • трансплантації кісткового мозку
    • імунних патологіях

    Біологічний сенс

    Hannum clock — це епігенетичний відбиток імунної системи.

    Якщо Horvath оцінює «вік організму» в цілому,
    то Hannum показує зношення крові та імунітету.

    Резюме

    • blood-specific епігенетичний годинник
    • 71 CpG
    • високочутливий до запалення, куріння, метаболічних порушень
    • сильний показник імунного старіння