HDAC клас III — це група ферментів, які є відмінними від HDAC класів I та II, оскільки вони належать до сімейства сиртуїнів (Sirtuins). Сиртуїни мають унікальну особливість — вони використовують нікотинамідаденіндинуклеотид (NAD+) як кофактор для своєї активності, що дозволяє їм здійснювати різні біохімічні реакції, зокрема деацетиляцію гістонів і інших білків.

HDAC клас II — це група гістондеацетилаз (HDACs), які виконують важливу роль у регуляції структурної організації хроматину та контролю транскрипції генів. HDAC класу II зазвичай локалізуються в ядрі, але можуть також переміщатися в цитоплазму в залежності від умов або стимулів. Вони сприяють деацетиляції гістонів і таким чином можуть змінювати доступність генетичної інформації для транскрипційного апарату, контролюючи активність специфічних генів.

HDAC клас I — це один із класів гістондеацетилаз (HDACs), які беруть участь у модифікації хроматину, зокрема шляхом деацетиляції гістонів, що веде до ущільнення хроматину і репресії транскрипції генів. HDAC клас I здебільшого локалізуються в ядрі клітини і активно беруть участь у регуляції експресії генів, що важливо для процесів клітинного циклу, розвитку та репарації ДНК.

Гістондеацетилази (HDACs) — це ферменти, які видаляють ацетильні групи з лізинових залишків на гістонових білках, що призводить до конденсації хроматину і гальмування транскрипції. Цей процес є важливим для регуляції генетичної експресії, оскільки він контролює доступність ДНК для транскрипційного апарату, зокрема для РНК-полімерази.

PCAF (P300/CBP-associated factor) — це гістонова ацетилтрансфераза (HAT), яка є частиною важливого комплексу для регуляції генетичної експресії через модифікацію хроматину. PCAF вносить ацетильні групи на лізинові залишки гістонів, що сприяє зміні структури хроматину і активує транскрипцію.

ADA (Ada, Spt, and Gcn5 acetyltransferase) — це багатокомпонентний коактиваторний комплекс, який активно бере участь у регуляції транскрипції шляхом модифікації хроматину, зокрема через ацетиляцію гістонів. Цей комплекс є важливою частиною механізмів активації транскрипції в еукаріотичних клітинах і забезпечує інтеграцію сигналів для точного контролю генетичної експресії.

SAGA (Spt-Ada-Gcn5-acetyltransferase) — це великий мультикомплекс білків, що виконує важливу роль у регуляції транскрипції через ацетиляцію гістонів і модифікацію хроматину. Він є одним із ключових коактиваторів, що допомагають активувати транскрипцію генів у клітинах еукаріот.

Gcn5 (General Control Non-repressed 5) — це гістонова ацетилтрансфераза, яка має важливу роль у регуляції транскрипції через модифікацію хроматину. Вона є частиною комплексу ацетилтрансфераз, що додає ацетильні групи до лізинових залишків на гістонах, зокрема в хроматині, що дозволяє змінити його структуру й активує транскрипцію певних генів.

Ацетилтрансферази — це ферменти, які додають ацетильні групи (-COCH₃) до молекул, зокрема до аміногруп на лізинових залишках гістонових білків. Цей процес називається ацетиляцією і є важливою модифікацією хроматину, яка регулює доступність ДНК для транскрипційних факторів та інших молекул, що забезпечують транскрипцію.

Розпускання хроматину — це процес, за допомогою якого структура хроматину змінюється таким чином, що ДНК стає більш доступною для транскрипції та інших клітинних процесів, таких як реплікація та ремонт ДНК. Цей процес здійснюється через різноманітні модифікації хроматину, які впливають на взаємодію між ДНК і гістоновими білками, а також на структуру хроматину.