Oct4 (Pou5f1) — центральний регулятор плюрипотентності та один з найважливіших факторів, що визначають ембріональний стан клітини. Його рівень та активність критично контролюють баланс між самооновленням, диференціацією та перепрограмувальною пластичністю.

Епігеном відображає функціональний стан клітини. З віком патерни ДНК-метиляції, гістонових модифікацій і хроматинової архітектури зміщуються у бік:

Фокус: вимірювання імунного старіння (immunosenescence) — вікових змін у популяціях і функції імунних клітин.

Ці годинники оцінюють не загальний біологічний вік, а вікову дисфункцію імунної системи, що є ключовим чинником:

DNAm GrimAge — це епігенетичний годинник третього покоління (Lu et al., 2019),
створений для максимально точного прогнозу смертності.

Його назва походить від «Grim Reaper» — тобто годинник, що передбачає наближення смерті.

PhenoAge — це епігенетичний годинник другого покоління (Levine et al., 2018),
створений для оцінки функціонального й фенотипового старіння, а не просто календарного віку.

Він базується не лише на DNAm, а на фізіологічному стані організму, тобто включає клінічні маркери, пов’язані зі смертністю.

Hannum clock (2013) — епігенетичний годинник, розроблений Г. Хеннумом.
Його особливість:

працює в основному на крові (blood-specific epigenetic clock).

Це не універсальна модель, як Horvath, а тканинно-специфічна.

Horvath clock — це перший загальнотканинний епігенетичний годинник, створений С. Горватом (2013).
Його завдання: обчислити біологічний вік за даними метиляції ДНК.

Епігенетичні годинники — це набори епігенетичних маркерів (передусім метиляції ДНК у конкретних CpG-сайтах), які дозволяють кількісно оцінити біологічний вік організму, тканини або клітини.