ECMDB — це безкоштовна, ретельно курована база даних, яка містить метаболомні дані та схеми метаболічних шляхів для бактерії Escherichia coli (штам K12, MG1655). База була розроблена лабораторією Девіда Вішарта в Університеті Альберти, Канада, і є частиною родини баз даних, що охоплюють метаболоми різних організмів, таких як HMDB (людина), YMDB (дріжджі), SMPDB (метаболічні шляхи) та інші.
Читати далі »ECMDB (E. coli Metabolome Database)YMDB — це база даних метаболітів дріжджів (Saccharomyces cerevisiae, пекарські/винні дріжджі). Вона ручної курованості (тобто дані з наукових публікацій, експериментів, підручників тощо) і охоплює метаболіти, що утворюються природним шляхом або під час ферментації / виробництва вина, пива, спиртного.
Читати далі »YMDB – Yeast Metabolome DatabaseHuman Metabolome Database (HMDB) — це безкоштовна електронна база даних, яка містить детальну інформацію про дрібні молекули‑метаболіти, що присутні в організмі людини. Використовується для метаболоміки, клінічної хімії, пошуку біомаркерів, навчання та науки. Базу створено та підтримує Human Metabolome Project (Університет Альберти, Канада) та інші партнери.
Читати далі »HMDB (Human Metabolome Database)Метаболо́м — це сукупність усіх малих молекул (метаболітів), які є присутніми в клітині, тканині, органі або організмі в певний момент часу.
Читати далі »Метаболом