Молекулярна біологія

Транскрипт (Первинний транскрипт) – одноланцюгова молекула РНК, синтезована шляхом транскрипції ДНК і процесована з метою отримання готових РНК-продуктів, таких як мРНК, тРНК і рРНК.

CRY1 (Cryptochrome 1) — білок‑регулятор, ключовий компонент молекулярних годинників циркадного ритму у людей і багатьох інших організмів. Його продукт бере участь у негативному зворотному зв’язку всередині циркадних коливань експресії генів, допомагаючи встановлювати періоди близько 24 годин. Зміни (поліморфізми, мутації) в гені CRY1 пов’язані з порушеннями сну, метаболічними змінами і потенційним впливом на різні системи органів.

Молекулярні будівельні блоки (ДНК, РНК, білок), які забезпечують наше існування, мають певну спрямованість. Наша ДНК скручується в одну сторону, а не в іншу. Білки складаються з так званих L-амінокислот, а не D-амінокислот.

Донедавна ~8% послідовності геному людини не були розшифровані. Тепер це послідовність – є! Але яку інформацію насправді повідомляє нам послідовність геному людини – чи це «книга життя», як ви її описуєте? Чому нам знадобилося так багато часу, щоб отримати повну послідовність, як це було зроблено? Які наслідки чи наступні кроки, тепер ми маємо повну послідовність..

Ген COL1A1 кодує альфа‑1 ланцюг типу I колагену — одного з найпоширеніших і найважливіших фібрилярних колагенів в організмі людини. Колаген I складається із двох альфа‑1 і одного альфа‑2 ланцюгів, і формує структури сполучної тканини, такі як кістка, дерма, сухожилки та рогівка. Мутації в COL1A1 викликають широке коло спадкових захворювань сполучної тканини, зокрема остеогенез imperfecta і деякі форми синдрому Елерса‑Данлоса.

Кліностатування — це процес, при якому організми або клітини піддаються умовам мікрогравітації або стимулюється відсутність нормального гравітаційного поля (поворот в умовах обертання на кліностаті).

Генно-інженерні методи перепрограмування клітин використовуються для змінювання фенотипу клітин, зокрема їхніх молекулярних та функціональних характеристик. Цей процес дозволяє клітинам переходити з одного стану в інший, наприклад, від соматичних клітин до плюрипотентних або навіть до спеціалізованих клітин через штучно введені гени або молекули. Перепрограмування клітин може бути використано для дослідження клітинної біології, лікування хвороб, а також у розробці нових методів лікування і регенеративної медицини.

Ацетилювання гістонів — це посттрансляційна модифікація, яка включає додавання ацетильних груп (-COCH₃) до аміногруп лізинових залишків у хвостах гістонів. Цей процес має важливе значення в регуляції структури хроматину та активності генів. Ацетилювання гістонів знижує взаємодію між гістонами та ДНК, що веде до розслаблення хроматину, а це сприяє активній транскрипції генів.

Транскрипційні фактори — це білки, які регулюють експресію генів, взаємодіючи з конкретними ділянками ДНК, що відповідають за ініціацію транскрипції (процес перетворення інформації з ДНК в РНК). Транскрипційні фактори можуть активувати або пригнічувати транскрипцію певних генів, таким чином регулюючи вироблення відповідних білків.

Тотипотентність, (вирівнювання потенціалів розвитку, вирівнювання потенціалів, всемогутність) — це здатність клітини розвиватися в повноцінний організм, включаючи всі типи клітин організму, а також клітини, що утворюють плаценту. Тотипотентні клітини мають максимальний потенціал до диференціації, оскільки вони здатні утворювати всі типи тканин, необхідні для розвитку організму та його підтримки, включаючи не тільки клітини всіх органів, але й клітини, які складають плаценту.

SRC-3 (Steroid Receptor Coactivator-3), також відомий як AIB1 (Amplified In Breast Cancer 1), є коактиватором транскрипції, який грає важливу роль у регуляції генів, що контролюються стероїдними гормонами. Він належить до родини коактиваторів стероїдних рецепторів і активно впливає на транскрипцію різних генів у відповідь на сигнали, отримані від стероїдних гормонів, таких як естрогени, тестостерон, прогестерон та глюкокортикоїди.

Репресорна регуляція — це процес, за допомогою якого певні молекули, зазвичай репресори — транскрипційні фактори, які гальмують або запобігають транскрипції певних генів. Репресори працюють, блокуючи взаємодію РНК-полімерази з промотором або змінюючи структуру хроматину, щоб обмежити доступ до ДНК. Це важливий механізм для контролю генетичної експресії, дозволяючи клітинам вимикати непотрібні або небажані гени в конкретних умовах або етапах розвитку.

TECTA (Tectorin Alpha) — ген, що кодує альфа-тектори́н, один із основних некалагенових компонентів текторної мембрани внутрішнього вуха. Ця мембрана взаємодіє з пучками стереоцілій спеціалізованих сенсорних волоскових клітин, перетворюючи механічні коливання звуку на електричні сигнали, що передаються до нервової системи. Мутації в гені TECTA призводять до двох форм несиндромної сенсоневральної глухоти: домінантної (DFNA8/12) та рецесивної (DFNB21).

Убіквітинування гістонів — це ще одна важлива посттранскрипційна модифікація, яка має значний вплив на регуляцію хроматинової структури та активність генів. Цей процес включає приєднання молекули убіквітину (білка, що складається з 76 амінокислот) до певних амінокислотних залишків на гістонах, що в свою чергу змінює фізико-хімічні властивості гістонів і, як результат, впливає на доступність ДНК для транскрипційного апарату.

Молекулярна біологія має широкий спектр застосувань у різних наукових, медичних, технологічних та екологічних областях. Ось як молекулярна біологія сприяє розвитку різних галузей:

Розщеплення хроматину — це важливий етап в методах молекулярної біології, таких як ChIP-seq (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing) або ChIP-chip. Це процес подрібнення хроматину на дрібні фрагменти, що дозволяє досліджувати конкретні взаємодії між білками та ДНК або визначати різні модифікації хроматину на рівні певних ділянок геному.

Методи рекомбінантної ДНК — це технології, які використовуються для створення нових молекул ДНК шляхом поєднання фрагментів ДНК з різних джерел. Ці методи дозволяють вченим маніпулювати генетичним матеріалом, інтегруючи, змінюючи або видаляючи специфічні гени в організмах або клітинах. Вони є основою для біотехнологій, створення генетично модифікованих організмів, а також для генотерапії та досліджень у молекулярній біології.

Метилчіпи (англ. methylation arrays) — це технологія для дослідження метилювання ДНК, яка дозволяє визначити рівень метилювання в різних ділянках геному, зазвичай в межах певних регіонів, таких як промотори генів або CpG-останні. Цей метод є більш швидким і менш затратним, ніж бісульфітне секвенування, і широко використовується в дослідженнях епігенетичних змін, які можуть впливати на генетичну регуляцію, розвиток захворювань, зокрема раку.

Епігенетичне омолодження або перепрограмування клітин — це процес, при якому відбуваються зміни в експресії генів без зміни самих генетичних послідовностей (ДНК). Замість цього ці зміни стосуються хімічних модифікацій ДНК або білків, що взаємодіють з ДНК, таких як метиляція ДНК, модифікація гістонів та інші епігенетичні механізми.

Myc — це клас транскрипційних факторів, які є важливими регуляторами клітинного циклу, росту та проліферації, а також диференціації клітин. Гени сімейства Myc широко вивчаються через свою роль у розвитку раку, оскільки їх активність може бути пов’язана з канцерогенезом (розвитком ракових захворювань).

TFIIF (Transcription Factor IIF) — це один із основних транскрипційних факторів, який бере участь у процесі ініціації транскрипції в еукаріотичних клітинах, зокрема у ініціації транскрипції за допомогою РНК-полімерази II. TFIIF є частиною преініціаційного комплексу (PIC), який формує стабільну платформу для початку синтезу мРНК.

OPN1SW — ген, який кодує один із опсинів колбочок сітківки людини, зокрема той, що відповідає за сприйняття короткохвильового світла (синього або ультрафіолетового діапазону). Опсини — це світлочутливі білки, які в колбочках та паличках сітківки забезпечують перетворення фотонів на біохімічні сигнали, що потім оброблюються нервовою системою. Правильна функція OPN1SW є критичною для нормального кольорового зору, особливо для сприйняття синіх відтінків, та для розрізнення кольору в умовах різного спектра освітлення.

Родопсин (від дав.-грец. ῥόδον — «роза», ὄψις — «зір») — це світлочутливий білковий пігмент, що відіграє ключову роль у зорі за умов низької освітленості. Цей пігмент локалізується в паличках сітківки — клітинах, що спеціалізуються на темновізенні (скотопічному зорі). Родопсин є представником родини G-білково‑приєднаних рецепторів (GPCR) і відповідає за перетворення світлового сигналу в електричний, що сприймає мозок

Що таке плазміди. Кальсіна Софія. Наукова Світлиця, 2018.

Плазміди — це невеликі, зазвичай кругові молекули ДНК, які знаходяться поза основним хромосомним матеріалом клітини і здатні до самовідтворення.

Праймери — це короткі олігонукеотидні послідовності (зазвичай 18–30 нуклеотидів), які використовуються в молекулярно-біологічних методах, таких як ПЦР (полімеразна ланцюгова реакція), для ініціації процесу синтезу нових ланцюгів ДНК. Праймери комплементарні до певних ділянок цільової ДНК, і вони забезпечують старт для ДНК-полімерази, що синтезує нову ланцюг ДНК.