Перейти до вмісту

Human Cell Atlas (HCA)

  • Human Cell Atlas — це міжнародна наукова співпраця, яка має на меті створити докладну карту всіх типів клітин людського тіла протягом життя.
  • Проєкт стартував у 2016 році.
  • HCA використовує сучасні методи: single‑cell транскриптоміка, просторові технології, аналіз на різних стадіях розвитку тканин, для багатьох органів і систем.
Читати далі »Human Cell Atlas (HCA)

NIH Roadmap Epigenomics

Це проєкт, що має на меті зібрати епігеномні дані (модифікації хроматину, доступність ДНК, метилювання, експресія тощо) для різних тканин / клітин людини. Дані централізовано розміщені у GEO (Gene Expression Omnibus) — базі даних NCBI.

Читати далі »NIH Roadmap Epigenomics

ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements — Енциклопедія елементів ДНК)

ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements — Енциклопедія елементів ДНК) — це великий науковий проєкт, мета якого — виявити всі функціональні елементи в геномі людини та миші.

Читати далі »ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements — Енциклопедія елементів ДНК)

VarElect

  • VarElect — це інструмент для пріоритизації генів з варіантами (наприклад, після секвенування із багатьох кандидатів), зважаючи на хворобу чи фенотип, який цікавить користувача.
  • Призначений для роботи з результатами Next‑Generation Sequencing (NGS), коли у вас є список генів, у яких знайдено варіанти, і потрібно зменшити цей список до найімовірніших кандидатів.
Читати далі »VarElect

GeneAlaCart

  • GeneAlaCart — інструмент пакетних (batch) запитів у GeneCards.
  • Дозволяє користувачу ввести список генів або ідентифікаторів і обрати, які поля чи анотації потрібні, і отримати результати у вигляді табличного файлу (наприклад, Excel або JSON).
Читати далі »GeneAlaCart

GeneAnalytics

GeneAnalytics — це інструмент аналізу наборів генів (gene set analysis), який допомагає швидко інтерпретувати дані з експериментів, таких як RNA‑seq, мікромаси або інші підходи, коли у вас є список генів, і ви хочете зрозуміти, з якими тканинами, хворобами, шляхами, молекулами або функціями вони пов’язані.

Читати далі »GeneAnalytics

PathCards

PathCards — це база даних про біологічні шляхи (pathways) у людини, яка об’єднує багато різних джерел, щоб спростити аналіз і зробити інформацію чіткішою.

Замість того, щоби просто показувати всі шляхи окремо від кожного джерела, PathCards групує та консолідує їх у SuperPaths — кластери шляхів, які мають схожий набір генів.

Читати далі »PathCards

MalaCards

MalaCards — це інтегрована база даних про людські хвороби, подібно до того, як GeneCards працює з генами.
Вона збирає дані з десятків джерел, щоб надати якнайповнішу інформацію про хвороби, їхню генетику, симптоми, пов’язані гени, клінічні тести, ліки тощо

Читати далі »MalaCards